在上古时期,仙界的(de )元始天尊和灵宝天尊(zūn )为了发展自己的势力(lì ),各自成立(lì )了阐教和截(jié )教,并在人(rén )界传道布教(jiāo ),扶持代理(lǐ )人。很快,双方(fāng )人马便爆(bào )发冲突,几千(qiān )年来一直摩擦不断,终(zhōng )于在人界引起一场旷(kuàng )世大战,俗称“封神之战(zhàn )”。封神之战,阐教(jiāo )势力大(dà )获全胜,但是元(yuán )始天尊的终极神器“打(dǎ )神鞭”却在战后销声匿(nì )迹,再无音讯。3000年后,“打神(shén )鞭”的下落重现于世,线(xiàn )索直指人间,为了找到(dào )“打神鞭”,阐教势力在人(rén )间成立了(le )“特殊事件管(guǎn )理局”(特(tè )管局)。特管(guǎn )局的成立(lì )并没有表面(miàn )看上去那(nà )么简单,似乎(hū )隐藏着巨大的阴谋。而(ér )截教的残余势力也成(chéng )立了“造神研究(jiū )所”,暗地(dì )里勾结妖界,研(yán )究人妖结合的终极力(lì )量,只为东山再起。《三魂(hún )纪》的故事序幕由此展(zhǎn )开。